行政部門職能
黨政辦：負責黨群組織建設工作；負責行政、宣傳及創建工作；負責綜合治理、物業管理、后勤保障及檔案管理工作；負責工會工作。
人力資源部：負責薪酬制度建設及績效考核管理工作；負責員工教育培訓及人才梯隊建設工作。
計劃財務部：負責財務預決算的制定工作；負責財務數據統計分析及企業生產、運營的指導工作；負責財稅紀律執行監督工作。
監察審計部：負責紀檢監察及工程、財務審計工作；負責工程、物資的詢價及邀標工作。
生產設備部：負責生產技術支持；負責安全生產監督管理工作；負責生產設備維護管理及水表的校檢工作。
企業發展部：負責參與集團戰略發展規劃的制定工作；負責政府重點工程及集團大型項目工程的建設管理工作。
鄉鎮辦：負責鄉鎮供水站的服務、指導及監督工作。
分公司部門職能
供水公司：負責自來水的生產及供應工作。
石城污水處理有限公司：負責城區生活污水的收集及處理運行工作。
水潤安裝有限公司：負責給排水工程的安裝施工及管理工作。
東亞大酒店資產管理辦公室：負責原東亞資產及人員的管理工作。
直屬單位部門職能
稽查處：負責用水市場的規范及管理。
客服中心：負責供水管網建設與改造計劃的確定；負責用戶申請接水的勘察設計、造價及驗收工作。
物資供應處：負責集團物資、設備的采購、倉儲及發放工作。
營銷公司：負責城區用戶的水表抄收工作；負責營業廳對外服務及相關業務的管理工作。
管線公司：負責城區及區域供水管網設施的巡檢、維護及水表拆換工作。
水質檢測中心：負責自來水及污水的水質檢測；負責凈水劑的檢測及生產指導的工作。
總調度中心：負責生產運行分析及調度工作；負責用戶訴求及網絡輿情的處理及監督；負責生產、辦公自動化系統的建設與維護；負責管網監控點的建設與維護。
供水站：負責管理區域內用戶的水表抄收及管網設施的巡查、維護工作；負責營業廳的對外服務及管理工作。